时间回转到1942年，中国大地正深陷于抗日战争的苦难之中，各地军民的反抗斗争进行得如火如荼之际……

中国云南由于它特殊的地缘关系成为抗日战争时期的一个重要战场，它离海不远，可以借道出国、借船出海。向东，可以通过越南进入北部湾，通往太平洋，向西，可以利用缅甸、泰国、印度，借助孟加拉湾到印度洋。于是，滇缅公路、滇越铁路…60年前从红土高原延伸出了这样一条条抗战生命线，它们构筑了高原新的脊梁。中国军民如何前仆后继地浴血奋战消灭日寇保卫抗战生命线的真实历史故事，便成为了《我的团长，我的团》的整个故事背景和立意所在。在一个离中缅边境不远叫作禅达的地方，一群来自五湖四海、不同出身不同身份甚至是不同政见的溃兵和百姓，因为种种命运际遇的原因而相会于此：北平人孟烦了、军医郝兽医、湖南兵不辣、上海军官阿译、东北佬迷龙、豆饼、要麻、蛇屁股、康丫、川妹子小醉……战争的苦难和身体的伤病让他们过着绝望的日子，他们互相厌憎又相依为命，不饿死不病死成为他们每天生存的最高目标。为了在严酷的战争环境下生存下来，别无选择的他们不得不摒弃前仇、恩怨、偏见、狭隘而团结一致组成一支小分队，在现实的困境中他们认识到了民族存亡的大义，于是义无返顾共同投入到打击日本侵略者、保卫家园、捍卫尊严、为抗战胜利不惜付出生命代价的正义斗争中，用血肉之躯书写一曲曲铁血卫国的悲壮战歌！

一场战役过后小分队死伤惨重，硝烟弥漫中突然闯进一人，这个用诡计杀死了在仓库外封杀的五个日本兵的诡异男人自称是川军团副团长龙文章！回到禅达，龙文章被宪兵逮捕，原来他不是什么团长，只是一个在团副死后摘了团副军衔给自己挂上的中尉。其他人被关在收容站，就在众人揣测身世极端坎坷的龙文章已经被枪毙之际，传来新师长虞啸卿正式任命龙文章为团长的消息……